RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 GSE1Q14687 1217 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-209ENST00000473406 DSG3P32926 999 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-209ENST00000473406 ARXQ96QS3 562 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-209ENST00000473406 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTB-209ENST00000473406 STK25O00506 426 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NUBP1P53384 320 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 P3H3Q8IVL6 736 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf37Q86TY3 774 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM212AQ96EL1 285 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-209ENST00000473406 STK24Q9Y6E0 443 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 HOMEZQ8IX15 550 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR70Q9NW82 654 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-209ENST00000473406 RASEFQ8IZ41 740 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CREBZFQ9NS37 354 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PYGBP11216 843 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR29P0C7W0 189 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROD2Q15784 382 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-209ENST00000473406 AKT1S1Q96B36 256 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 E2F4Q16254 413 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MFRPQ9BY79 579 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA3EO15041 775 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-209ENST00000473406 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYND10O75800 440 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R37O75864 691 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PSEN1P49768 467 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP6P59044 892 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 BARGINQ6ZT62 677 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PITPNM1O00562 1244 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX12O15370 315 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 AK7Q96M32 723 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CABP2Q9NPB3 220 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE4AP27815 886 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD10Q14728 455 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CHADLQ6NUI6 762 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYND15Q9H091 742 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-209ENST00000473406 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNL1Q8IU54 200 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IL27Q8NEV9 243 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK2BQ13554 666 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE4DQ08499 809 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM66O15016 1216 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K13O43283 966 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF12Q96FN5 646 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms