RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM41Q8WV44 630 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-207ENST00000470201 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGGTB-207ENST00000470201 EVX2Q03828 476 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-207ENST00000470201 BCANQ96GW7 911 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP44Q96MT7 982 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-207ENST00000470201 GSE1Q14687 1217 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-207ENST00000470201 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-207ENST00000470201 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NUBP1P53384 320 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CREBZFQ9NS37 354 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM212AQ96EL1 285 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-207ENST00000470201 GABBR2O75899 941 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-207ENST00000470201 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-207ENST00000470201 RASEFQ8IZ41 740 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 STK25O00506 426 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-207ENST00000470201 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCN6P51797 869 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PYGBP11216 843 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 STK24Q9Y6E0 443 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-207ENST00000470201 NBR1Q14596 966 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF12Q96QT6 1004 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEIP0CG38 1075 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-207ENST00000470201 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-207ENST00000470201 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-207ENST00000470201 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-207ENST00000470201 LHX8Q68G74 356 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-207ENST00000470201 P3H3Q8IVL6 736 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-207ENST00000470201 PSEN1P49768 467 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF12Q96FN5 646 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-207ENST00000470201 MFRPQ9BY79 579 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP3K13O43283 966 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR70Q9NW82 654 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNL1Q8IU54 200 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX12O15370 315 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP6P59044 892 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CABP2Q9NPB3 220 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TRPC6Q9Y210 931 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC39A7Q92504 469 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 METRNQ9UJH8 293 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R37O75864 691 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 TIE1P35590 1138 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 C7P10643 843 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEB2H3BUK9 544 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 E2F4Q16254 413 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 OTUD5Q96G74 571 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA2Q08379 1002 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEFA5A3E0 1075 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE4AP27815 886 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD10Q14728 455 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEJP0CG39 1038 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms