RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-203ENST00000468641 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
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PTPRZ1-203ENST00000468641 GSE1Q14687 1217 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 GABBR2O75899 941 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 KIF12Q96FN5 646 aa17.79■□□□□ 0.44
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PTPRZ1-203ENST00000468641 MAP3K13O43283 966 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRZ1-203ENST00000468641 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
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PTPRZ1-203ENST00000468641 STK25O00506 426 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 C7P10643 843 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 STK24Q9Y6E0 443 aa17.05■□□□□ 0.32
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PTPRZ1-203ENST00000468641 OCEL1Q9H607 264 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTPRZ1-203ENST00000468641 MFRPQ9BY79 579 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRZ1-203ENST00000468641 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRZ1-203ENST00000468641 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRZ1-203ENST00000468641 PLCG2P16885 1265 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRZ1-203ENST00000468641 SOX12O15370 315 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRZ1-203ENST00000468641 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRZ1-203ENST00000468641 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTPRZ1-203ENST00000468641 PPP1R37O75864 691 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRZ1-203ENST00000468641 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRZ1-203ENST00000468641 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRZ1-203ENST00000468641 MICALL2Q8IY33 904 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1-203ENST00000468641 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1-203ENST00000468641 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRZ1-203ENST00000468641 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRZ1-203ENST00000468641 G3V3G9 751 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRZ1-203ENST00000468641 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRZ1-203ENST00000468641 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRZ1-203ENST00000468641 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1-203ENST00000468641 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1-203ENST00000468641 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRZ1-203ENST00000468641 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRZ1-203ENST00000468641 CFAP44Q96MT7 982 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRZ1-203ENST00000468641 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.32■□□□□ 0.2
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