RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 LHX8Q68G74 356 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRG-202ENST00000468576 NUBP1P53384 320 aa17.25■□□□□ 0.35
PTPRG-202ENST00000468576 FBXO3Q9UK99 471 aa17.25■□□□□ 0.35
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRG-202ENST00000468576 KIF12Q96FN5 646 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRG-202ENST00000468576 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PTPRG-202ENST00000468576 MAP3K13O43283 966 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRG-202ENST00000468576 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRG-202ENST00000468576 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRG-202ENST00000468576 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PTPRG-202ENST00000468576 TRPC6Q9Y210 931 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRG-202ENST00000468576 FAM212AQ96EL1 285 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRG-202ENST00000468576 POTEB2H3BUK9 544 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRG-202ENST00000468576 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRG-202ENST00000468576 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRG-202ENST00000468576 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRG-202ENST00000468576 METRNQ9UJH8 293 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 TIE1P35590 1138 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 SLC39A7Q92504 469 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 KLHL34Q8N239 644 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 C7P10643 843 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 IFNL1Q8IU54 200 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRG-202ENST00000468576 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRG-202ENST00000468576 PYGBP11216 843 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-202ENST00000468576 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-202ENST00000468576 OTUD5Q96G74 571 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-202ENST00000468576 POTEFA5A3E0 1075 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRG-202ENST00000468576 POTEJP0CG39 1038 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRG-202ENST00000468576 GSE1Q14687 1217 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRG-202ENST00000468576 SPOCK2Q92563 424 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRG-202ENST00000468576 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRG-202ENST00000468576 IER5LQ5T953 404 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRG-202ENST00000468576 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PTPRG-202ENST00000468576 SEC24BO95487 1268 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRG-202ENST00000468576 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRG-202ENST00000468576 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRG-202ENST00000468576 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRG-202ENST00000468576 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRG-202ENST00000468576 PLCG2P16885 1265 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRG-202ENST00000468576 PSEN1P49768 467 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRG-202ENST00000468576 OCEL1Q9H607 264 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRG-202ENST00000468576 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRG-202ENST00000468576 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM41Q8WV44 630 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-202ENST00000468576 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRG-202ENST00000468576 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRG-202ENST00000468576 GOLGA2Q08379 1002 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRG-202ENST00000468576 POTEMA6NI47 508 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 CABP2Q9NPB3 220 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 POTEGQ6S5H5 508 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRG-202ENST00000468576 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRG-202ENST00000468576 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRG-202ENST00000468576 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRG-202ENST00000468576 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRG-202ENST00000468576 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRG-202ENST00000468576 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRG-202ENST00000468576 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRG-202ENST00000468576 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRG-202ENST00000468576 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRG-202ENST00000468576 ST18O60284 1047 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRG-202ENST00000468576 PKD2Q13563 968 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-202ENST00000468576 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-202ENST00000468576 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-202ENST00000468576 SOX12O15370 315 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 SNPHO15079 494 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 RGL2O15211 777 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRG-202ENST00000468576 G3V3G9 751 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRG-202ENST00000468576 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRG-202ENST00000468576 STK24Q9Y6E0 443 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRG-202ENST00000468576 MICALL2Q8IY33 904 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 STK25O00506 426 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 MARVELD3Q96A59 401 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 MFRPQ9BY79 579 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRG-202ENST00000468576 NLRP6P59044 892 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRG-202ENST00000468576 EMP3P54852 163 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRG-202ENST00000468576 POTEB3A0JP26 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRG-202ENST00000468576 POTEBQ6S5H4 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRG-202ENST00000468576 DOK7Q18PE1 504 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRG-202ENST00000468576 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms