RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHG5O94827 1062 aa8.95□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf37Q86TY3 774 aa8.95□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.9□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE6P0CI01 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 GSE1Q14687 1217 aa8.85□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 P3H3Q8IVL6 736 aa8.81□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.8□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 OSCARQ8IYS5 282 aa8.8□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 STK25O00506 426 aa8.77□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 NUBP1P53384 320 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 AKT1S1Q96B36 256 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR70Q9NW82 654 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 STK24Q9Y6E0 443 aa8.67□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.66□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM212AQ96EL1 285 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 NEUROD2Q15784 382 aa8.61□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.57□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PITPNM1O00562 1244 aa8.51□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 PYGBP11216 843 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 RASEFQ8IZ41 740 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F4Q16254 413 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 CREBZFQ9NS37 354 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYND10O75800 440 aa8.45□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA3EO15041 775 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYND15Q9H091 742 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 HAX1O00165 279 aa8.42□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR29P0C7W0 189 aa8.4□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 BARGINQ6ZT62 677 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 MFRPQ9BY79 579 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 AK7Q96M32 723 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 EVX2Q03828 476 aa8.33□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 IL27Q8NEV9 243 aa8.32□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R37O75864 691 aa8.31□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 HRCP23327 699 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PSEN1P49768 467 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP6P59044 892 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID3AQ99856 593 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4AP27815 886 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX12O15370 315 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 MFSD10Q14728 455 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM66O15016 1216 aa8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4DQ08499 809 aa8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.22□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms