RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.26■□□□□ 0.35
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PTPRK-211ENST00000429595 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
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PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K13O43283 966 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO3Q9UK99 471 aa17.07■□□□□ 0.32
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PTPRK-211ENST00000429595 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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PTPRK-211ENST00000429595 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-211ENST00000429595 OCEL1Q9H607 264 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-211ENST00000429595 POTEMA6NI47 508 aa16.31■□□□□ 0.2
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PTPRK-211ENST00000429595 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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PTPRK-211ENST00000429595 CABP2Q9NPB3 220 aa16.17■□□□□ 0.18
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PTPRK-211ENST00000429595 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRK-211ENST00000429595 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 ST18O60284 1047 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRK-211ENST00000429595 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRK-211ENST00000429595 SNPHO15079 494 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRK-211ENST00000429595 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 MICALL2Q8IY33 904 aa15.76■□□□□ 0.11
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PTPRK-211ENST00000429595 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 STK24Q9Y6E0 443 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 STK25O00506 426 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 MFRPQ9BY79 579 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 EMP3P54852 163 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 NLRP6P59044 892 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 POTEB3A0JP26 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 POTEBQ6S5H4 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 FAM205CA6NFA0 338 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.56■□□□□ 0.08
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