RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000386307.1

SNORD12C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12C, Length 89 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.55□□□□□ -1.36
SNORD12C-201ENST00000386307 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.54□□□□□ -1.36
SNORD12C-201ENST00000386307 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD12C-201ENST00000386307 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SNORD12C-201ENST00000386307 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD12C-201ENST00000386307 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNORD12C-201ENST00000386307 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SNORD12C-201ENST00000386307 POTEFA5A3E0 1075 aa6.44□□□□□ -1.38
SNORD12C-201ENST00000386307 MMRN1Q13201 1228 aa6.39□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.36□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 ST18O60284 1047 aa6.35□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.35□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 KIF12Q96FN5 646 aa6.35□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 TIE1P35590 1138 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SNORD12C-201ENST00000386307 TRPC6Q9Y210 931 aa6.33□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 SEC24BO95487 1268 aa6.32□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.31□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.3□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 IER5LQ5T953 404 aa6.29□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.28□□□□□ -1.4
SNORD12C-201ENST00000386307 MAP3K13O43283 966 aa6.27□□□□□ -1.41
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SNORD12C-201ENST00000386307 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.24□□□□□ -1.41
SNORD12C-201ENST00000386307 SNPHO15079 494 aa6.19□□□□□ -1.42
SNORD12C-201ENST00000386307 MARVELD3Q96A59 401 aa6.19□□□□□ -1.42
SNORD12C-201ENST00000386307 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.19□□□□□ -1.42
SNORD12C-201ENST00000386307 PLCG2P16885 1265 aa6.18□□□□□ -1.42
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SNORD12C-201ENST00000386307 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.15□□□□□ -1.42
SNORD12C-201ENST00000386307 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.14□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.14□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 EMP3P54852 163 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 PROM2Q8N271 834 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 PLEKHG5O94827 1062 aa6.11□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 IFNL1Q8IU54 200 aa6.1□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 OCEL1Q9H607 264 aa6.1□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 POTEB3A0JP26 581 aa6.09□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 POTEBQ6S5H4 581 aa6.09□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.09□□□□□ -1.43
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM205CA6NFA0 338 aa6.05□□□□□ -1.44
SNORD12C-201ENST00000386307 MIER1Q8N108 512 aa6.05□□□□□ -1.44
SNORD12C-201ENST00000386307 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.04□□□□□ -1.44
SNORD12C-201ENST00000386307 NUBP1P53384 320 aa6.02□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.01□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM212AQ96EL1 285 aa5.98□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SNORD12C-201ENST00000386307 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.96□□□□□ -1.46
SNORD12C-201ENST00000386307 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.93□□□□□ -1.46
SNORD12C-201ENST00000386307 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SNORD12C-201ENST00000386307 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SNORD12C-201ENST00000386307 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.9□□□□□ -1.46
SNORD12C-201ENST00000386307 ERBB3P21860 1342 aa5.9□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 PYGBP11216 843 aa5.89□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 PTGER2P43116 358 aa5.88□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 GOLGA2Q08379 1002 aa5.88□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.87□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 DOK7Q18PE1 504 aa5.85□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.84□□□□□ -1.47
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.83□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 RIMBP2O15034 1052 aa5.81□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.81□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 G3V3G9 751 aa5.8□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.8□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 PSEN1P49768 467 aa5.78□□□□□ -1.48
SNORD12C-201ENST00000386307 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.77□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.77□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.74□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 GSE1Q14687 1217 aa5.72□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 GPR153Q6NV75 609 aa5.72□□□□□ -1.49
SNORD12C-201ENST00000386307 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 EHMT2Q96KQ7 1210 aa5.71□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 CABP2Q9NPB3 220 aa5.7□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 HCSTQ9UBK5 93 aa5.69□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.67□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 PBX2P40425 430 aa5.65□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 ARSIQ5FYB1 569 aa5.65□□□□□ -1.5
SNORD12C-201ENST00000386307 MICALL2Q8IY33 904 aa5.64□□□□□ -1.51
SNORD12C-201ENST00000386307 RGS20O76081 388 aa5.61□□□□□ -1.51
SNORD12C-201ENST00000386307 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
SNORD12C-201ENST00000386307 POTEEQ6S8J3 1075 aa5.59□□□□□ -1.51
SNORD12C-201ENST00000386307 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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