RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
RNU6-187P-201ENST00000384139 POTEJP0CG39 1038 aa9.76□□□□□ -0.85
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RNU6-187P-201ENST00000384139 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-187P-201ENST00000384139 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMRN1Q13201 1228 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC24BO95487 1268 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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RNU6-187P-201ENST00000384139 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNU6-187P-201ENST00000384139 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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RNU6-187P-201ENST00000384139 TIE1P35590 1138 aa9.48□□□□□ -0.89
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RNU6-187P-201ENST00000384139 IER5LQ5T953 404 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-187P-201ENST00000384139 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
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RNU6-187P-201ENST00000384139 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.36□□□□□ -0.91
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RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP3K13O43283 966 aa9.34□□□□□ -0.91
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RNU6-187P-201ENST00000384139 PLCG2P16885 1265 aa9.28□□□□□ -0.92
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RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.15□□□□□ -0.94
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RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.12□□□□□ -0.95
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RNU6-187P-201ENST00000384139 MIER1Q8N108 512 aa9.09□□□□□ -0.95
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RNU6-187P-201ENST00000384139 IFNL1Q8IU54 200 aa9.08□□□□□ -0.96
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RNU6-187P-201ENST00000384139 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-187P-201ENST00000384139 DOK7Q18PE1 504 aa8.8□□□□□ -1
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RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.66□□□□□ -1.02
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RNU6-187P-201ENST00000384139 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSE1Q14687 1217 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCSTQ9UBK5 93 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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RNU6-187P-201ENST00000384139 CABP2Q9NPB3 220 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-187P-201ENST00000384139 PBX2P40425 430 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-187P-201ENST00000384139 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-187P-201ENST00000384139 RGS20O76081 388 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARSIQ5FYB1 569 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL34Q8N239 644 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-187P-201ENST00000384139 MICALL2Q8IY33 904 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO3Q9UK99 471 aa8.36□□□□□ -1.07
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