RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.11□□□□□ -0.79
RRN3-202ENST00000327307 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.1□□□□□ -0.79
RRN3-202ENST00000327307 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RRN3-202ENST00000327307 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-202ENST00000327307 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-202ENST00000327307 RAD21O60216 631 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 CLSTN1O94985 981 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 PKD2Q13563 968 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 ZNF592Q92610 1267 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 RGS22Q8NE09 1264 aa10.04□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.04□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 PSMD1Q99460 953 aa10.02□□□□□ -0.8
RRN3-202ENST00000327307 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.02□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 AAMPQ13685 434 aa10.01□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 ZNF428Q96B54 188 aa10.01□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 MTMR7Q9Y216 660 aa9.99□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 NACADO15069 1562 aa9.98□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 CERS3Q8IU89 383 aa9.96□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RRN3-202ENST00000327307 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.95□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 USP35Q9P2H5 1018 aa9.95□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 ARID3CA6NKF2 412 aa9.9□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 NEUROD2Q15784 382 aa9.9□□□□□ -0.82
RRN3-202ENST00000327307 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.89□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.87□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 APBB1O00213 710 aa9.85□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.84□□□□□ -0.83
RRN3-202ENST00000327307 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 E9PSI1 815 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.82□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 CCDC27Q2M243 656 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-202ENST00000327307 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.77□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 PTMSP20962 102 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.75□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 CNPY4Q8N129 248 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-202ENST00000327307 CCDC125Q86Z20 511 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 KDM4AO75164 1064 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 MAFGO15525 162 aa9.67□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.67□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.66□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 ANAPC15P60006 121 aa9.66□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.66□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RRN3-202ENST00000327307 MCCP23508 829 aa9.65□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.61□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 RGL2O15211 777 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 GPATCH11Q8N954 259 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.59□□□□□ -0.87
RRN3-202ENST00000327307 WWC1Q8IX03 1113 aa9.58□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RRN3-202ENST00000327307 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms