RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 ARID3AQ99856 593 aa16.87■□□□□ 0.29
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RIMS1-201ENST00000264839 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RIMS1-201ENST00000264839 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
RIMS1-201ENST00000264839 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.79■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.79■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 PLCB2Q00722 1185 aa16.78■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RIMS1-201ENST00000264839 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.77■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RGS3P49796 1198 aa16.74■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 A0A0G2JS52 829 aa16.73■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.72■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.72■□□□□ 0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BECN1Q14457 450 aa16.7■□□□□ 0.26
RIMS1-201ENST00000264839 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RIMS1-201ENST00000264839 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.68■□□□□ 0.26
RIMS1-201ENST00000264839 NEUROD2Q15784 382 aa16.67■□□□□ 0.26
RIMS1-201ENST00000264839 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.64■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.63■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.63■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 ABCC9O60706 1549 aa16.61■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.6■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.58■□□□□ 0.25
RIMS1-201ENST00000264839 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 RGL3Q3MIN7 710 aa16.58■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 C14orf37Q86TY3 774 aa16.53■□□□□ 0.24
RIMS1-201ENST00000264839 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.51■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.49■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RIMS1-201ENST00000264839 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
RIMS1-201ENST00000264839 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RIMS1-201ENST00000264839 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RIMS1-201ENST00000264839 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
RIMS1-201ENST00000264839 DRC7Q8IY82 874 aa16.37■□□□□ 0.21
RIMS1-201ENST00000264839 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.37■□□□□ 0.21
RIMS1-201ENST00000264839 CASC1Q6TDU7 716 aa16.36■□□□□ 0.21
RIMS1-201ENST00000264839 APBB1O00213 710 aa16.35■□□□□ 0.21
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.33■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.31■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.31■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.3■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 HSCBQ8IWL3 235 aa16.29■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.29■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 FGD1P98174 961 aa16.28■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 SCRIBQ14160 1630 aa16.28■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 KCNH8Q96L42 1107 aa16.28■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 TSPY4P0CV99 314 aa16.28■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 TSPY10P0CW01 314 aa16.28■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
RIMS1-201ENST00000264839 SOX12O15370 315 aa16.27■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 KCNJ4P48050 445 aa16.27■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 SLC4A3P48751 1232 aa16.26■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.24■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 CLIP1P30622 1438 aa16.22■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.21■□□□□ 0.19
RIMS1-201ENST00000264839 PDE4CQ08493 712 aa16.2■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.2■□□□□ 0.18
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RIMS1-201ENST00000264839 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.19■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 CFAP53Q96M91 514 aa16.19■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.18■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.18■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 CLSTN1O94985 981 aa16.17■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD1Q16676 465 aa16.17■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 CEP162Q5TB80 1403 aa16.16■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RIMS1-201ENST00000264839 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.09■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
RIMS1-201ENST00000264839 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RIMS1-201ENST00000264839 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RIMS1-201ENST00000264839 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.07■□□□□ 0.16
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