RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 ABCC8Q09428 1581 aa12□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP53Q96M91 514 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 ARID3CA6NKF2 412 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 KANK1Q14678 1352 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRB-201ENST00000261266 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 FKBP8Q14318 412 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 FMN1Q68DA7 1419 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 MRS2Q9HD23 443 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 MS4A1P11836 297 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CUX2O14529 1486 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 BECN1Q14457 450 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP44Q96MT7 982 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 CASC1Q6TDU7 716 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 NUDCQ9Y266 331 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 SMARCA4P51532 1647 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 CCER2I3L3R5 266 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRB-201ENST00000261266 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 SOGA1O94964 1423 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 TMF1P82094 1093 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRB-201ENST00000261266 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 MIER1Q8N108 512 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 WIZO95785 1651 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 KCNH8Q96L42 1107 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 PTMSP20962 102 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRB-201ENST00000261266 RALBP1Q15311 655 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 UACAQ9BZF9 1416 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 CUX1P39880 1505 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 POGKQ9P215 609 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRB-201ENST00000261266 NCAPD3P42695 1498 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 C14orf37Q86TY3 774 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 STAC3Q96MF2 364 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 RGL3Q3MIN7 710 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 BCL11AQ9H165 835 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 MCCP23508 829 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 PDE3BQ13370 1112 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 KIF21BO75037 1637 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRB-201ENST00000261266 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 MORC1Q86VD1 984 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRB-201ENST00000261266 NGEFQ8N5V2 710 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms