RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253332.5

AKAP12-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 12, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP12, Length 6,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP12-201ENST00000253332 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
AKAP12-201ENST00000253332 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
AKAP12-201ENST00000253332 FKBP8Q14318 412 aa20.79■□□□□ 0.92
AKAP12-201ENST00000253332 RGL3Q3MIN7 710 aa20.75■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.75■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 TSPY4P0CV99 314 aa20.74■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 TSPY10P0CW01 314 aa20.74■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 MLECQ14165 292 aa20.71■□□□□ 0.91
AKAP12-201ENST00000253332 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.7■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 NBR1Q14596 966 aa20.69■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 SOX12O15370 315 aa20.67■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.65■□□□□ 0.9
AKAP12-201ENST00000253332 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
AKAP12-201ENST00000253332 NEUROD2Q15784 382 aa20.58■□□□□ 0.89
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.58■□□□□ 0.89
AKAP12-201ENST00000253332 CLSTN1O94985 981 aa20.56■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 SCRIBQ14160 1630 aa20.55■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 MRS2Q9HD23 443 aa20.54■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
AKAP12-201ENST00000253332 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AKAP12-201ENST00000253332 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AKAP12-201ENST00000253332 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.48■□□□□ 0.87
AKAP12-201ENST00000253332 POGKQ9P215 609 aa20.47■□□□□ 0.87
AKAP12-201ENST00000253332 GOLGA2Q08379 1002 aa20.45■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.4■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
AKAP12-201ENST00000253332 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AKAP12-201ENST00000253332 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 CFAP53Q96M91 514 aa20.3■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 ERCC6Q03468 1493 aa20.3■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 PLCB2Q00722 1185 aa20.29■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 FGD1P98174 961 aa20.28■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.27■□□□□ 0.84
AKAP12-201ENST00000253332 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.26■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 STK26Q9P289 416 aa20.23■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 CASC1Q6TDU7 716 aa20.22■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 KCNJ4P48050 445 aa20.22■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.21■□□□□ 0.83
AKAP12-201ENST00000253332 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.18■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.15■□□□□ 0.82
AKAP12-201ENST00000253332 APBB1O00213 710 aa20.14■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 GGT6Q6P531 493 aa20.14■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 RGS3P49796 1198 aa20.12■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 PDE4CQ08493 712 aa20.11■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 NUDCQ9Y266 331 aa20.09■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 BECN1Q14457 450 aa20.08■□□□□ 0.81
AKAP12-201ENST00000253332 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.07■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 G3V3G9 751 aa20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 MSH5O43196 834 aa20.03■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 NUTM2FA1L443 756 aa20.02■□□□□ 0.8
AKAP12-201ENST00000253332 MIER1Q8N108 512 aa20.01■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 KLHL34Q8N239 644 aa20.01■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.01■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.99■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 CDCA8Q53HL2 280 aa19.99■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.97■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
AKAP12-201ENST00000253332 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.95■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.91■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 CLIP1P30622 1438 aa19.9■□□□□ 0.78
AKAP12-201ENST00000253332 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.89■□□□□ 0.77
AKAP12-201ENST00000253332 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
AKAP12-201ENST00000253332 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.88■□□□□ 0.77
AKAP12-201ENST00000253332 MORC1Q86VD1 984 aa19.88■□□□□ 0.77
AKAP12-201ENST00000253332 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms