RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LYZ	P61626	148 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	JPT2	Q9H910	190 aa		5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BTX0	84 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF56	Q15929	161 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.42	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ACYP1	P07311	99 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		P0DMU3	169 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM231A	P0DMU4	169 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM231C	P0DMU5	169 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EIM0	57 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	CXCL5	P42830	114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	CFHR3	Q02985	330 aa		5.41	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.4	□□□□□ -1.54
LETMD1-238	ENST00000623495	AGRN	O00468	2067 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE2B	O14633	110 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7A2P2	O60397	106 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PYY	P10082	97 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LEP	P41159	167 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	FXYD7	P58549	80 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		Q86TA4	180 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.4	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	ATOX1	O00244	68 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PGP	A6NDG6	321 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BT86	120 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TCRA	P04437	139 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSG	P08311	255 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CKS2	P33552	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB1	P60022	68 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		I3L2K1	104 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	MORN5	Q5VZ52	161 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00643	Q86TS7	51 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	OXT	P01178	125 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N8P6	123 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		F8VRH5	84 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		H7C1H1	209 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CFC1	P0CG37	223 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	CD69	Q07108	199 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-17	P01599	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PFN2	P35080	140 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		J3QQQ9	107 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	GP9	P14770	177 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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