RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-30P01768 117 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-33P01772 117 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 FRZBQ92765 325 aa7.64□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF185Q96GF1 192 aa7.64□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 GAS8-AS1O95177 125 aa7.63□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 AMN1Q8IY45 258 aa7.63□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.61□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.6□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WX48 190 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.59□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM262E9PQX1 116 aa7.59□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 MPV17L2Q567V2 206 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.59□□□□□ -1.19
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CCL3L3-201ENST00000612839 NCR2O95944 276 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 COTL1Q14019 142 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 KLK12Q9UKR0 248 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A8P05109 93 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE6Q13070 117 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 ST20Q9HBF5 79 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 PKHD1P08F94 4074 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 I3L3M4 83 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BKO60814 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BJP06899 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BOP23527 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BBP33778 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 AMTP48728 403 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BDP58876 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BCP62807 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 COX19Q49B96 90 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 PMCHP20382 165 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 CKS2P33552 79 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 ENHOQ6UWT2 76 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2WQ96B02 151 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WTM6 91 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GUV1 79 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 D6R8Y8 96 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 PSCAO43653 123 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 TSHBP01222 138 aa7.54□□□□□ -1.2
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