RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 H3BRM9 83 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 ETDBQ3ZM63 59 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 NOTCH1P46531 2555 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 J3QQQ9 107 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PLA2G2AP14555 144 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 Q6ZTI0 123 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.34□□□□□ -1.07
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1W2PPM0 123 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 C12orf74Q32Q52 190 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TEX29Q8N6K0 151 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 A8MWV9 139 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 CRYGDP07320 174 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 M0QY20 66 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 GAGE6Q13070 117 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF575Q86XF7 245 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01006Q8NI28 216 aa8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.31□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 J3QR89 54 aa8.31□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF580Q9UK33 172 aa8.31□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBX1P62877 108 aa8.31□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM141Q96I45 108 aa8.3□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 INAFM1C9JVW0 142 aa8.3□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.3□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 A0A0J9YY99 117 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 LGALS9O00182 355 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 K7EP34 96 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 Q6ZSN1 163 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 WFDC2Q14508 124 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 Q6ZUT4 128 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM101Q96IK0 257 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 NDUFA7O95182 113 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GV72 72 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM89A2RUT3 159 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 SIVA1O15304 175 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 STAB1Q9NY15 2570 aa8.27□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 IGLL5B9A064 214 aa8.27□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 E9PLD3 99 aa8.27□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 MED14OSP0DP75 135 aa8.27□□□□□ -1.08
TOP3A-217ENST00000584582 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.27□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.27□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 RHODO00212 210 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 C9orf85Q96MD7 179 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 A4D1N5 150 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 ERG28Q9UKR5 140 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 ZFHX3Q15911 3703 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 COL6A5A8TX70 2615 aa8.26□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TSHBP01222 138 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 LINC00315P59091 139 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 PTH2Q96A98 100 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 A0A096LNT2 108 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB135Q30KP9 77 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 RHOHQ15669 191 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM238C9JI98 176 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 CRLF1O75462 422 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 PFN2P35080 140 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 C9JAW5 83 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 C5orf38Q86SI9 138 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TIMM17AQ99595 171 aa8.24□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.23□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 IGIPA6NJ69 53 aa8.23□□□□□ -1.09
TOP3A-217ENST00000584582 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.23□□□□□ -1.09
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