RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 TNFRSF6BO95407 300 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 XGP55808 180 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 PMCHL1Q16048 86 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.37□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 PRSS47A8MTI9 375 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 EPM2AB3EWF7 344 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 NPYP01303 97 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 C3orf79P0CE67 100 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.36□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 A0A096LPF7 62 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 SMKR1H3BMG3 65 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 NCR2O95944 276 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZTI0 123 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 Q8N8P6 123 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 C9orf85Q96MD7 179 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.35□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 HBDP02042 147 aa9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 MGPP08493 103 aa9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 PET117Q6UWS5 81 aa9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 C20orf78Q9BR46 151 aa9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 VAMP8Q9BV40 100 aa9.34□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01546A6NGU7 62 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 H3BNG1 76 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 K7EMI3 77 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF415Q09FC8 603 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.33□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 G0S2P27469 103 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP10-1P60331 282 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 Q5VSD8 79 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 PTH2Q96A98 100 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 SPXQ9BT56 116 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.31□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.31□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 FCER1GP30273 86 aa9.31□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 NRACQ8N912 160 aa9.31□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01549A6NIU2 74 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 F5H697 171 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 LAGE3Q14657 143 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 PRO1933Q9H354 126 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 MDFICQ9P1T7 246 aa9.3□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 H7C1H1 209 aa9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 SIVA1O15304 175 aa9.29□□□□□ -0.92
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SPNS3-202ENST00000572078 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF876PQ49A33 203 aa9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ST20Q9HBF5 79 aa9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.29□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 A8MWV9 139 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 M0R2P5 195 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 ATP5LO75964 103 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 DDTP30046 118 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 HAMPP81172 84 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 Q8N976 141 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 RASL10AQ92737 203 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 C18orf15Q96N68 181 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS3-202ENST00000572078 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WTM6 91 aa9.27□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 TCAPO15273 167 aa9.27□□□□□ -0.93
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SPNS3-202ENST00000572078 ZNF56Q15929 161 aa9.27□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 VCYO14598 125 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 SPATA45Q537H7 98 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.26□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WWL8 130 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 RHODO00212 210 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 GAS8-AS1O95177 125 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3-53P01767 116 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 A0A096LNJ9 63 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.24□□□□□ -0.93
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