RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 PRO0255Q9UI72 69 aa5.7□□□□□ -1.5
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TMOD3-211ENST00000561438 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-211ENST00000561438 IQCJQ1A5X6 159 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-211ENST00000561438 ESRGQ1W209 222 aa5.69□□□□□ -1.5
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TMOD3-211ENST00000561438 TRGC2P03986 189 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-211ENST00000561438 RAB5AP20339 215 aa5.68□□□□□ -1.5
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TMOD3-211ENST00000561438 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 PKHD1P08F94 4074 aa5.62□□□□□ -1.51
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TMOD3-211ENST00000561438 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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TMOD3-211ENST00000561438 H7C1H1 209 aa5.62□□□□□ -1.51
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TMOD3-211ENST00000561438 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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TMOD3-211ENST00000561438 ST20Q9HBF5 79 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 LINC01546A6NGU7 62 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 PPBPP02775 128 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 COX19Q49B96 90 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 MPV17L2Q567V2 206 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-211ENST00000561438 Q8N8P6 123 aa5.61□□□□□ -1.51
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