RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PRM2P04554 102 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF876PQ49A33 203 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WTM6 91 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 D6R8Y8 96 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 CIDEAO60543 219 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 CRYGDP07320 174 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 CKS2P33552 79 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00310P59036 64 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PRELID3AQ96N28 172 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01546A6NGU7 62 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RHODO00212 210 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM17P0DL12 118 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 AZU1P20160 251 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PKIAP61925 76 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TSTD3H0UI37 97 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 K7EMI3 77 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 RS1O15537 224 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 PMCHP20382 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SSTP61278 116 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 IQCJQ1A5X6 159 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NRACQ8N912 160 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf78Q9BR46 151 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00587B1AMM8 73 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 H3BNG1 76 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SERF1AO75920 110 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TNFRSF6BO95407 300 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NPYP01303 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00614P0C842 121 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 H7C1H1 209 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 M0QY20 66 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 PSCAO43653 123 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NUPR1O60356 82 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NIT1Q86X76 327 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 JPT2Q9H910 190 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WWL8 130 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE12BA1L429 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE7O76087 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAS8-AS1O95177 125 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NCR2O95944 276 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 OXTP01178 125 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-53P01767 116 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE12FP0CL80 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE12GP0CL81 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE12IP0CL82 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N8P6 123 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SMKR1H3BMG3 65 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 HSBP1O75506 76 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 MGPP08493 103 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 A0A096LPF7 62 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01549A6NIU2 74 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TCAPO15273 167 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF56Q15929 161 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZTI0 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 FA2HQ7L5A8 372 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.27□□□□□ -1.41
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