RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560333.1

PDE8A-212, Transcript of phosphodiesterase 8A, humanhuman

TSL 3

Gene PDE8A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8A-212ENST00000560333 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 PRSS47A8MTI9 375 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 D6R8Y8 96 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 CDK2AP2O75956 126 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 NCR2O95944 276 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 NPYP01303 97 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-53P01767 116 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 SRIP30626 198 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 C12orf74Q32Q52 190 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 A0A0J9YWU9 116 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 Q0VG73 95 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 MRAP2Q96G30 205 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 F5H697 171 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 NUPR1O60356 82 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 CIDEAO60543 219 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 TNFRSF6BO95407 300 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 PPBPP02775 128 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 MGPP08493 103 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 P0DMU3 169 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 FAM231AP0DMU4 169 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 FAM231CP0DMU5 169 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 DEFB130BP0DP73 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 DEFB130AP0DP74 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 IQCJQ1A5X6 159 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 ORMDL3Q8N138 153 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 PRELID3AQ96N28 172 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 RHODO00212 210 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 RTL8CO15255 209 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 TRIAP1O43715 76 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 SMIM17P0DL12 118 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 CKS2P33552 79 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01546A6NGU7 62 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 C16orf90A8MZG2 172 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00694P0DN24 101 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 RAB5BP61020 215 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 ZNF56Q15929 161 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.02□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 CRYBA4P53673 196 aa7.02□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 DAD1P61803 113 aa7.02□□□□□ -1.29
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PDE8A-212ENST00000560333 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 C5orf52A6NGY3 159 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 K7EQD1 137 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 ESDP10768 282 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZTC4 211 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 NIT1Q86X76 327 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 C20orf78Q9BR46 151 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 IFITM10A6NMD0 228 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 NDUFA6P56556 154 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 Q8N8P6 123 aa7□□□□□ -1.29
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PDE8A-212ENST00000560333 DNAJC30Q96LL9 226 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 HHLA3Q9XRX5 114 aa7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 A0A096LNJ9 63 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 EPM2AB3EWF7 344 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 M0R2N4 97 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 SERF1AO75920 110 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 ATP5G1P05496 136 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 IGKV2-30P06310 120 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2D3P61077 147 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2D2P62837 147 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 PRO0255Q9UI72 69 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE8A-212ENST00000560333 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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