RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554196.1

LINC00520-202, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00520, Length 514 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-202ENST00000554196 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 OR11H2Q8NH07 326 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 ZNF479Q96JC4 524 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PRSS1P07477 247 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PLNP26678 52 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 ANK2Q01484 3957 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 A0A087WX48 190 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 F8VRH5 84 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DPM2O94777 84 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DDTP30046 118 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 CRYBA4P53673 196 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 KRTAP10-11P60412 298 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 Q6ZSN1 163 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 Q8NAQ8 132 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PRO1933Q9H354 126 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 IGIPA6NJ69 53 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 P0DMU3 169 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 FAM231AP0DMU4 169 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 FAM231CP0DMU5 169 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 EMP1P54849 157 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 UBE2D3P61077 147 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 UBE2D2P62837 147 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 ATOH7Q8N100 152 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 BAALCQ8WXS3 180 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 DKK2Q9UBU2 259 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE10A6NGK3 116 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 IGKCP01834 107 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 LINC00694P0DN24 101 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 FHL2Q14192 279 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 PMVKQ15126 192 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 G3V4G9 280 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 H7C423 109 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 IGLC3P0DOY3 106 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 DEFB130BP0DP73 79 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 DEFB130AP0DP74 79 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 DAD1P61803 113 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 PRO0255Q9UI72 69 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 hDV102S1A0JD36 115 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE12JA6NER3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 ATP5G1P05496 136 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GYPEP15421 78 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 DEFA6Q01524 100 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE1Q13065 139 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE4Q13068 117 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE5Q13069 117 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 GAGE13Q4V321 117 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 LINC00587B1AMM8 73 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 COX8AP10176 69 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 HERVK_113P61574 105 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 MAJINQ3KP22 176 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 TMEM243Q9BU79 118 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 VCX2Q9H322 139 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 CST9LQ9H4G1 147 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00520-202ENST00000554196 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms