RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552123.1

NPIPB12-208, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family, member B12, human

TSL 4

Gene NPIPB12, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC01587	Q99440	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		M0QY20	66 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RHOD	O00212	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RS1	O15537	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	FXYD7	P58549	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		H7C1H1	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	NCR2	O95944	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	HBD	P02042	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	FCER1G	P30273	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	CKS1B	P61024	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	VCY	O14598	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLL1	P15814	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	AZU1	P20160	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LAGE3	Q14657	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q6ZN92	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	JPT2	Q9H910	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A087WWL8	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	APOC4	P55056	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRM2	P04554	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		F5H697	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		J3QR89	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	ATP5L	O75964	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	MGP	P08493	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	HTN1	P15515	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTDAP	P60985	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	RHOH	Q15669	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123		I3L3M4	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPIPB12-208	ENST00000552123	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms