RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549655.5

BRF1-215, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-215	ENST00000549655	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655		K7EQD1	137 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	EMP1	P54849	157 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	COTL1	Q14019	142 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	SIVA1	O15304	175 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-215	ENST00000549655	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	C11orf86	A6NJI1	115 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	WIPF1	O43516	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655		X6R8D5	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	CIDEA	O60543	219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	VCX2	Q9H322	139 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	APOC4	P55056	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655		E9PLD3	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	GAGE1	Q13065	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	GAGE4	Q13068	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	GAGE5	Q13069	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	UBE2D3	P61077	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	UBE2D2	P62837	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-215	ENST00000549655	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	NPS	P0C0P6	89 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	AMELX	Q99217	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	HIGD1B	Q9P298	99 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	CRYBA4	P53673	196 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	HSD52	Q0P140	79 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	FHL2	Q14192	279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	HERVK_113	P61574	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655		A0A0J9YXV3	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655		Q6ZUT4	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-215	ENST00000549655	SEC11A	P67812	179 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655		Q6ZVH6	145 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	DEFB4A	O15263	64 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-215	ENST00000549655	TMEM223	A0PJW6	202 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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