RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543754.1

PUS1-209, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PUS1, Length 1,378 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-209ENST00000543754 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.25□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 LINC01620Q4KN68 170 aa7.24□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 NAT8Q9UHE5 227 aa7.24□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 KLK12Q9UKR0 248 aa7.24□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 A0A1B0GUT8 65 aa7.23□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.23□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.23□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 ISOC2Q96AB3 205 aa7.23□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 HIGD1CA8MV81 97 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 LECT2O14960 151 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 CRPP02741 224 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 RAB14P61106 215 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 UBE2WQ96B02 151 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.22□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 NCR2O95944 276 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 COTL1Q14019 142 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 MIAQ16674 131 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 MPV17L2Q567V2 206 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 GATD1Q8NB37 220 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 TMEM243Q9BU79 118 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 V9GYV3 84 aa7.21□□□□□ -1.25
PUS1-209ENST00000543754 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 A0A1B0GUV1 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 C9JQL5 133 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 RBX1P62877 108 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 RIGQ13278 110 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 ADIRFQ15847 76 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 Q8N976 141 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PRR34Q9NV39 138 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 A0A1B0GW15 77 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 ENHOQ6UWT2 76 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 SCXQ7RTU7 201 aa7.2□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 UBE2L6O14933 153 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PPP1R17O96001 155 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 AMTP48728 403 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 GAGE6Q13070 117 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 C14orf177Q52M58 125 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 NUP35Q8NFH5 326 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 MRAP2Q96G30 205 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.18□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.18□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.18□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 H7C423 109 aa7.18□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 BAALCQ8WXS3 180 aa7.18□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 I3L3M4 83 aa7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 ST20Q9HBF5 79 aa7.17□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PPP1R2P9O14990 202 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 APCSP02743 223 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 S100A8P05109 93 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 RAB4AP20338 218 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 REG3AQ06141 175 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 PMCHP20382 165 aa7.15□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 CLLU1Q5K131 121 aa7.15□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 AMN1Q8IY45 258 aa7.15□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.15□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 RNF185Q96GF1 192 aa7.15□□□□□ -1.26
PUS1-209ENST00000543754 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.14□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 LINC00862A6NCI5 91 aa7.14□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.14□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.14□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 F8W036 122 aa7.13□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 VCYO14598 125 aa7.13□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.13□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.13□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 TCAPO15273 167 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 HLA-DQA1P01909 254 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 MT-ND4LP03901 98 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 CAMPP49913 170 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 HBBP68871 147 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 UQCC3Q6UW78 93 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 TMEM101Q96IK0 257 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 BTF3L4Q96K17 158 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 USP17L23D6RBM5 183 aa7.11□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 TSHBP01222 138 aa7.11□□□□□ -1.27
PUS1-209ENST00000543754 PPBPP02775 128 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms