RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539232.1

LMO3-220, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-220ENST00000539232 KLLNB2CW77 178 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GGTLC3B5MD39 225 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 M0QXV9 152 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PEX7O00628 323 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 SPINK4O60575 86 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 DAD1P61803 113 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GNG5P63218 68 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 RIGQ13278 110 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GAGE13Q4V321 117 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 Q6ZTI0 123 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 FMC1Q96HJ9 113 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 Q9H3A6 140 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 DNAH2Q9P225 4427 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 M0R2N4 97 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LEPP41159 167 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PDE6HQ13956 83 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 Q6Q795 121 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 SGK494Q96LW2 274 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 MLST8Q9BVC4 326 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 A0A1B0GWB2 263 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PGPA6NDG6 321 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 F5H768 121 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GAGE7O76087 117 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 P01737 135 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 SPINK8P0C7L1 97 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GAGE12FP0CL80 117 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GAGE12GP0CL81 117 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GAGE12IP0CL82 117 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 CAMPP49913 170 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 FOXI1Q12951 378 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 CEND1Q8N111 149 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ODF3Q96PU9 254 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 SPXQ9BT56 116 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 MDFICQ9P1T7 246 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PSG8Q9UQ74 426 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 A0A0J9YY99 117 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 A0A1B0GUT8 65 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LINC01546A6NGU7 62 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LYRM9A8MSI8 78 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 APOMO95445 188 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 IGLV2-11P01706 119 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 EVI2AP22794 236 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ASIPP42127 132 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ZNF138P52744 262 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ZNF575Q86XF7 245 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C16orf74Q96GX8 76 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LINC00477Q96M19 166 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LINC00479Q96M42 142 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TMEM126AQ9H061 195 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 OTORQ9NRC9 128 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 PRO0461Q9UI25 63 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 EPDR1Q9UM22 224 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 RTL8CO15255 209 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 GNRH2O43555 120 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ATP5LO75964 103 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LTAP01374 205 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 IGHV3-53P01767 116 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 HBDP02042 147 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 Q6ZUT4 128 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 RAB37Q96AX2 223 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 C8orf49Q96NF6 230 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 CDIP1Q9H305 208 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-220ENST00000539232 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 GAGE12JA6NER3 117 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 ATP5G1P05496 136 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 GAGE4Q13068 117 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 WFDC2Q14508 124 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 ETDBQ3ZM63 59 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-220ENST00000539232 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms