RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 AMTP48728 403 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 Q5BKY6 102 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 CST9LP1Q5W188 147 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 NIT2Q9NQR4 276 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 PTTG1IPP53801 180 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 COTL1Q14019 142 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 BAGE2Q86Y30 109 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 CARD19Q96LW7 228 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRU-209ENST00000526080 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0U1RQV1 116 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 PAGE4O60829 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 ALG5Q9Y673 324 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1W2PNN7 141 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 CACNG7P62955 275 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 NTF3P20783 257 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZNX1 250 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 H7C423 109 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 XCL1P47992 114 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 SYCNQ0VAF6 134 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 TPPP3Q9BW30 176 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 MT-ND6P03923 174 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 TRGC1P0CF51 173 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 FGF6P10767 208 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRU-209ENST00000526080 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CCL25O15444 150 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 NCR2O95944 276 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 DEFA1P59665 94 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf137Q5JT78 98 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 TMUB2Q71RG4 321 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 GATD1Q8NB37 220 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 PFDN1O60925 122 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CAMPP49913 170 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE2BQ13066 116 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 DIRC1Q969H9 104 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 F2Z2F3 143 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 G3V3Q6 166 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 H0Y9J4 135 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 APCSP02743 223 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV7-43P04211 117 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 BCL2P10415 239 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CTRLP40313 264 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 PRR4Q16378 134 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 NUP35Q8NFH5 326 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 C11orf52Q96A22 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CNFNQ9BYD5 112 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CENPWQ5EE01 88 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ISOC2Q96AB3 205 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GV50 99 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 APOMO95445 188 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ESDP10768 282 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 XKRY2A2RUG3 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM12Q96EX1 92 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM101Q96IK0 257 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 IFNA1P01562 189 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 SS18Q15532 418 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms