RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMBIM6	P55061	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPCS2	Q15005	226 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384		A0A087X002	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2L6	O14933	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	CRIP1	P50238	77 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	SH2D1A	O60880	128 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	APOM	O95445	188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	CAMP	P49913	170 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB32	Q13637	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384		H3BMQ9	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	XCL1	P47992	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	MED28	Q9H204	178 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384		A0A1W2PPV4	95 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384		M0QY20	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL15RA	Q13261	267 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384		Q86TA4	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTP4A2-208	ENST00000524384	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCL25	O15444	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF861P	O60384	105 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	DEFA3	P59666	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384		V9GYH0	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSHB	P01222	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	GCHFR	P30047	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2B	P63146	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	COTL1	Q14019	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	BTC	P35070	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SST	P61278	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	USH2A	O75445	5202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384		M0QXV9	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	BCL2L11	O43521	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SNAI2	O43623	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	MGP	P08493	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	PEX7	O00628	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ESD	P10768	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	MAL	P21145	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.8 ms