RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	C20orf202	A1L168	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		A8MWV9	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		M0QY20	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	LAGE3	Q14657	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		H0Y8G0	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	RHOD	O00212	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	RS1	O15537	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	NUDT3	O95989	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		P0DMU3	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PKIA	P61925	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		H7C1H1	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		K7EMI3	77 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	VCY	O14598	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZSN1	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZTI0	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	IGLL5	B9A064	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GCSH	P23434	173 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	ATP5L	O75964	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE7	O76087	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	EMP1	P54849	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-231	ENST00000514183	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GVY2	172 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		I3L3M4	83 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	TSHB	P01222	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	PRSS1	P07477	247 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	RHOH	Q15669	191 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	MIF	P14174	115 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	G0S2	P27469	103 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DDT	P30046	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZN92	141 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183		Q9UF83	564 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RACK1-231	ENST00000514183	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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