RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	EREG	O14944	169 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKC	P01834	107 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TSHB	P01222	138 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZSN1	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	COX8A	P10176	69 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508		P0DMU3	169 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	STPG4	Q8N801	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	BAALC	Q8WXS3	180 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508		F8VRH5	84 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	PLN	P26678	52 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZTI0	123 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0J9YWU9	116 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB4A	O15263	64 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	DLEU1	O43261	78 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	CIDEA	O60543	219 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	FGF6	P10767	208 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	PMVK	Q15126	192 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508		X6R8D5	127 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508		Q9UF83	564 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508		K7EQD1	137 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	NMU	P48645	174 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	CST9L	Q9H4G1	147 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE7	O76087	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE12F	P0CL80	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE12G	P0CL81	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE12I	P0CL82	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	BATF	Q16520	125 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508		Q8NAQ8	132 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	SIVA1	O15304	175 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	TCTA	P57738	103 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	COTL1	Q14019	142 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	NPS	P0C0P6	89 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	PCP2	Q8IVA1	136 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	MIF	P14174	115 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GV90	55 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	CRYBA4	P53673	196 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM18-208	ENST00000497508	EMP1	P54849	157 aa		10.3	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms