RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 ERASQ7Z444 233 aa6.27□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 A8MZ25 164 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 COTL1Q14019 142 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 MAJINQ3KP22 176 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE12JA6NER3 117 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE1Q13065 139 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE4Q13068 117 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE5Q13069 117 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE13Q4V321 117 aa6.26□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 Q8NAQ8 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DKK2Q9UBU2 259 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 hDV102S1A0JD36 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DAD1P61803 113 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 FHL2Q14192 279 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.25□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM141Q96I45 108 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 ZMAT4Q9H898 229 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DDTP30046 118 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 BAALCQ8WXS3 180 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 TIMM17AQ99595 171 aa6.24□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 ANK2Q01484 3957 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 A0A087WX48 190 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 IGIPA6NJ69 53 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DPM2O94777 84 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 IGKCP01834 107 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 UBE2D3P61077 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 UBE2D2P62837 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 RETNQ9HD89 108 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 F8VRH5 84 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PMVKQ15126 192 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 C14orf144Q96I85 54 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PRO0255Q9UI72 69 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 CELA1Q9UNI1 258 aa6.22□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 LINC00587B1AMM8 73 aa6.21□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 ATP5G1P05496 136 aa6.21□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PLNP26678 52 aa6.21□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 STPG4Q8N801 248 aa6.21□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.21□□□□□ -1.41
SNHG16-202ENST00000493536 PAX4O43316 350 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 GYPEP15421 78 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 HTN3P15516 51 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 CRYBA4P53673 196 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TCTAP57738 103 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 VCX2Q9H322 139 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.21□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 F5H768 121 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 IGLC3P0DOY3 106 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 CST9LQ9H4G1 147 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 UBE2L6O14933 153 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 DEFA6Q01524 100 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.2□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 A0A0J9YY99 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 CTAG1AP78358 180 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 MRAPQ8TCY5 172 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 NMUP48645 174 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.19□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 K7EIL1 84 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM243Q9BU79 118 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 A0A096LPF7 62 aa6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms