RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266		D6R8Y8	96 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	APCS	P02743	223 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB4B	P61018	213 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZTC4	211 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MWV9	139 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGP	P08493	103 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT-ND6	P03923	174 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRI	P30626	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYBA4	P53673	196 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAD1	P61803	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A096LNJ9	63 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0J9YY99	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKS2	P33552	79 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF56	Q15929	161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX19	Q49B96	90 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EQD1	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSHB	P01222	138 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A8	P05109	93 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTN3	P15516	51 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q0VG73	95 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A096LPF7	62 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266		F5H768	121 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCAP	O15273	167 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERF1A	O75920	110 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5G1	P05496	136 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2D3	P61077	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2D2	P62837	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	NIT1	Q86X76	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPBP	P02775	128 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA6	P56556	154 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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