RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 H3BMM0 161 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 C2orf82Q6UX34 121 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 CLEC2BQ92478 149 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2WQ96B02 151 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 RS1O15537 224 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 PROK1P58294 105 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM126AQ9H061 195 aa7.54□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 H7C423 109 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 IFITM1P13164 125 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 TTC32Q5I0X7 151 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 H3BUA1 57 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 HTN1P15515 57 aa7.53□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 VPS13CQ709C8 3753 aa7.52□□□□□ -1.2
VWA3B-217ENST00000489630 SORL1Q92673 2214 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 Q9UF83 564 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 A6NDX4 124 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV1-40P01703 118 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.52□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 DAND5Q8N907 189 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 PRM2P04554 102 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 KLRB1Q12918 225 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 DUX3Q96PT4 197 aa7.51□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 KNCNA6PVL3 124 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 K7EMT4 169 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 MIAQ16674 131 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01600Q96MT4 127 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.5□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PRX2 142 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 CFHR3Q02985 330 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 SPANXCQ9NY87 97 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 J3QLI3 93 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 K7EQG2 157 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 Q6Q795 121 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.49□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 C19orf84I3L1E1 186 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 COX6CP09669 75 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZSN1 163 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 H3BT86 120 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 LST1O00453 97 aa7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.47□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 SYNJ2BPP57105 145 aa7.47□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.47□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.46□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.46□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.46□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.46□□□□□ -1.21
VWA3B-217ENST00000489630 PSMB8P28062 276 aa7.46□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.46□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.46□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0U1RRA0 63 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 CREBBPQ92793 2442 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 AVPP01185 164 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 C3orf56Q8N813 242 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.45□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 J3KT08 172 aa7.44□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 SPG11Q96JI7 2443 aa7.44□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV4-59P01825 116 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 V9GYY9 64 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 COX6A2Q02221 97 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM101Q96IK0 257 aa7.43□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 NACAE9PAV3 2078 aa7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00694P0DN24 101 aa7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.42□□□□□ -1.22
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFA1O15239 70 aa7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms