RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.34□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TCAPO15273 167 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 GAS8-AS1O95177 125 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 HBDP02042 147 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 FHL2Q14192 279 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 RTL8CO15255 209 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 NPYP01303 97 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV3-53P01767 116 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 FCER1GP30273 86 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 Q9UF83 564 aa7.32□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A0J9YY99 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 H7C1H1 209 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ATP5LO75964 103 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAH2Q9P225 4427 aa7.31□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A1B0GVY2 172 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 M0QY20 66 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 RHODO00212 210 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 DDTP30046 118 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LAGE3Q14657 143 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.3□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SMKR1H3BMG3 65 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 CIDEAO60543 219 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 NCR2O95944 276 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 MGPP08493 103 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 NRACQ8N912 160 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 UPK3BQ9BT76 320 aa7.29□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 F5H697 171 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 VCYO14598 125 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00694P0DN24 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 CRYBA4P53673 196 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF56Q15929 161 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TTC32Q5I0X7 151 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 Q9H8V8 135 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 ST20Q9HBF5 79 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 PRO0255Q9UI72 69 aa7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PAX4O43316 350 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 ESRGQ1W209 222 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 SPATA45Q537H7 98 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC01545Q5VT33 79 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 C6orf223Q8N319 242 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 Q8N976 141 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 KIR2DL4Q99706 377 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PRO1933Q9H354 126 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.27□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A096LPF7 62 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 K7EQD1 137 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.26□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00587B1AMM8 73 aa7.25□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.25□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS1P07477 247 aa7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 RHOHQ15669 191 aa7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 Q6ZN92 141 aa7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.24□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A096LNJ9 63 aa7.23□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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