RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 CT83Q5H943 113 aa15.01□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.01□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 ZNF727A8MUV8 499 aa14.99□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 FAM229AH3BQW9 127 aa14.99□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 REG3AQ06141 175 aa14.99□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 COTL1Q14019 142 aa14.99□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 A0A1B0GUV1 79 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 AMTP48728 403 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 C14orf177Q52M58 125 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 PRSS1P07477 247 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 SCXQ7RTU7 201 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-208ENST00000481518 HIGD1CA8MV81 97 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 GAS8-AS1O95177 125 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 TSKUQ8WUA8 353 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 OSTCQ9NRP0 149 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 C9JQL5 133 aa14.94□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 UBE2L6O14933 153 aa14.94□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.94□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 V9GYV3 84 aa14.93□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 A0A1B0GUT8 65 aa14.92□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.92□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.92□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 BORCS7Q96B45 105 aa14.92□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 TEX261Q6UWH6 196 aa14.91□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 ISOC2Q96AB3 205 aa14.91□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.91□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 FAM231BA6NCW3 169 aa14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 RNF185Q96GF1 192 aa14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.9□□□□□ -0.02
PSME4-208ENST00000481518 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 NCR2O95944 276 aa14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.89□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 APCSP02743 223 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 RAB4AP20338 218 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 RPS10P46783 165 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 AMN1Q8IY45 258 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 NUP35Q8NFH5 326 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 I3L3M4 83 aa14.85□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 TSHBP01222 138 aa14.85□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 PMCHP20382 165 aa14.85□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 ADIRFQ15847 76 aa14.85□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 FGF6P10767 208 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 NAT8Q9UHE5 227 aa14.84□□□□□ -0.03
PSME4-208ENST00000481518 H7C423 109 aa14.83□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 MRAP2Q96G30 205 aa14.83□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 ST20Q9HBF5 79 aa14.83□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 hDV102S1A0JD36 115 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 SMKR1H3BMG3 65 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 ESDP10768 282 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 RIGQ13278 110 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 PEA15Q15121 130 aa14.82□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 SLPIP03973 132 aa14.81□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.81□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 PANO1I0J062 215 aa14.8□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.8□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 C15orf56Q8N910 161 aa14.8□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.79□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.79□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 NRACQ8N912 160 aa14.78□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.78□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 MYCBP2O75592 4640 aa14.77□□□□□ -0.04
PSME4-208ENST00000481518 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 CAMPP49913 170 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 BTF3L4Q96K17 158 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 FOXI1Q12951 378 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME4-208ENST00000481518 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms