RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 LECT2O14960 151 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 RAB4AP20338 218 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 MPV17L2Q567V2 206 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 AMN1Q8IY45 258 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 UBE2WQ96B02 151 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 RNF185Q96GF1 192 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 COX11Q9Y6N1 276 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 ELOBQ15370 118 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM97Q5BJF2 176 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 BAALCQ8WXS3 180 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM262E9PQX1 116 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 RMI2Q96E14 147 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 HBBP68871 147 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 ENHOQ6UWT2 76 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 S100A8P05109 93 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 MRAP2Q96G30 205 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM70Q9BUB7 260 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GXF2 115 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 GAS8-AS1O95177 125 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 Q0VG73 95 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 Q8N976 141 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 IQCJQ1A5X6 159 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 HAMPP81172 84 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 EPM2AB3EWF7 344 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 SMKR1H3BMG3 65 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 PKIAP61925 76 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 IMMP2LQ96T52 175 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 SDHAF1A6NFY7 115 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 RBX1P62877 108 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 COTL1Q14019 142 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 ST20Q9HBF5 79 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 NCR2O95944 276 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 RPS10P46783 165 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 GAGE6Q13070 117 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 BTF3L4Q96K17 158 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 PRR34Q9NV39 138 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRD-210ENST00000481079 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 PPP1R17O96001 155 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 CRPP02741 224 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 PMCHP20382 165 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 CKS2P33552 79 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 Q5VSD8 79 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZSA8 131 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 I3L3M4 83 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 AMTP48728 403 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 MIAQ16674 131 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM243Q9BU79 118 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 APOC3P02656 99 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 RHEBQ15382 184 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 NRACQ8N912 160 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFA5Q16718 116 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 LINC01620Q4KN68 170 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRD-210ENST00000481079 D6R8Y8 96 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 S100PP25815 95 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 MYCBP2O75592 4640 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GUV1 79 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 VCYO14598 125 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 UBE2L6O14933 153 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 APCSP02743 223 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 PPBPP02775 128 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 SVBPQ8N300 66 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TNFRSF6BO95407 300 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TSHBP01222 138 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms