RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOHQ15669 191 aa9.98□□□□□ -0.81
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SH3BP1-206ENST00000469947 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 Q9UF83 564 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.97□□□□□ -0.81
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP1-206ENST00000469947 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA7O95182 113 aa9.82□□□□□ -0.84
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SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.81□□□□□ -0.84
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