RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 I3L3M4 83 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TSHBP01222 138 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 FABP9Q0Z7S8 132 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM97Q5BJF2 176 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS47A8MTI9 375 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 VCYO14598 125 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 RAB5AP20339 215 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 PMCHP20382 165 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 COTL1Q14019 142 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 IQCJQ1A5X6 159 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 SIVA1O15304 175 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 LYSTQ99698 3801 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 AMTP48728 403 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 NIT1Q86X76 327 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM243Q9BU79 118 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 Q9H8V8 135 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-211ENST00000460176 TRGC2P03986 189 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 ESDP10768 282 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N3U1 123 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N8P6 123 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 TCAPO15273 167 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 FCER1GP30273 86 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DL4Q99706 377 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-30P01768 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-33P01772 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE6Q13070 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 MPV17L2Q567V2 206 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZR54 194 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 H7C423 109 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 PKIAP61925 76 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 RBX1P62877 108 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N976 141 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WX48 190 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01546A6NGU7 62 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM262E9PQX1 116 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 K7EMI3 77 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 M0R2N4 97 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2L6O14933 153 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 TTC32Q5I0X7 151 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1B0GUV1 79 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 K7EP13 123 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 FGF6P10767 208 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 LAGE3Q14657 143 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 FA2HQ7L5A8 372 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 KLK12Q9UKR0 248 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-211ENST00000460176 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00614P0C842 121 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 Q0VG73 95 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM18Q96B42 140 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BKO60814 126 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms