RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 MLST8Q9BVC4 326 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 A0A096LNI7 61 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 CACNG7P62955 275 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0J9YXV3 536 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 TRGC1P0CF51 173 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 CENPWQ5EE01 88 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 TMUB2Q71RG4 321 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 NIT2Q9NQR4 276 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 XKRY2A2RUG3 117 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 GAS8-AS1O95177 125 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 IGLC6P0CF74 106 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GVG6 124 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 UMAD1C9J7I0 102 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 SMLR1H3BR10 107 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA1P01562 189 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 APCSP02743 223 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 XCL1P47992 114 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.42□□□□□ -1.38
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DDX39B-211ENST00000449757 GNG13Q9P2W3 67 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 F2Z2F3 143 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 G3V3Q6 166 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 NTF3P20783 257 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 GNG4P50150 75 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 TWIST1Q15672 202 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZNX1 250 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZRP5 223 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 MANBALQ9NQG1 85 aa6.41□□□□□ -1.38
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DDX39B-211ENST00000449757 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 RAB19A4D1S5 217 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP10-8P60410 259 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 FOXI1Q12951 378 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 C11orf52Q96A22 123 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-211ENST00000449757 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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DDX39B-211ENST00000449757 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.39□□□□□ -1.39
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DDX39B-211ENST00000449757 GATD1Q8NB37 220 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM101Q96IK0 257 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 BTF3L4Q96K17 158 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 BCL2L11O43521 198 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 NCR2O95944 276 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE2BQ13066 116 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF345Q14585 488 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 RGS21Q2M5E4 152 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 BIN3Q9NQY0 253 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 H7C423 109 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 MT-ND6P03923 174 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 CTRLP40313 264 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 CCL20P78556 96 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SYCNQ0VAF6 134 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM12Q96EX1 92 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 MED9Q9NWA0 146 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.36□□□□□ -1.39
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DDX39B-211ENST00000449757 PMCHP20382 165 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 CAMPP49913 170 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 PTTG1IPP53801 180 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SS18Q15532 418 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 ISOC2Q96AB3 205 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 TEX46H3BTG2 121 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 PDE6DO43924 150 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 BCL2P10415 239 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 MALP21145 153 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT11Q96G61 164 aa6.35□□□□□ -1.39
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