RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZN92 141 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERASQ7Z444 233 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 STAB1Q9NY15 2570 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WX48 190 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPSP0C0P6 89 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX8AP10176 69 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZSN1 163 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8NAQ8 132 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM141Q96I45 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF479Q96JC4 524 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 hDV102S1A0JD36 115 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 H0Y8G0 127 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DPM2O94777 84 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLNP26678 52 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB135Q30KP9 77 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIMM17AQ99595 171 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DKK2Q9UBU2 259 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12BA1L429 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EQD1 137 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 SIVA1O15304 175 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE7O76087 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKCP01834 107 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12FP0CL80 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12GP0CL81 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12IP0CL82 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 FHL2Q14192 279 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8VRH5 84 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCP4P48539 62 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGIPA6NJ69 53 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSHBP01222 138 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRYBA4P53673 196 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 P0DMU3 169 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM231AP0DMU4 169 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM231CP0DMU5 169 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 EMP1P54849 157 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2D3P61077 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2D2P62837 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 COTL1Q14019 142 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 BAALCQ8WXS3 180 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRO0255Q9UI72 69 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB130BP0DP73 79 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB130AP0DP74 79 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 FGF6P10767 208 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMVKQ15126 192 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 H7C423 109 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EP13 123 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5G1P05496 136 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00694P0DN24 101 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAD1P61803 113 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 STPG4Q8N801 248 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q9UF83 564 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BNG1 76 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EIL1 84 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPATA25Q9BR10 227 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIGD1BQ9P298 99 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 CST9LQ9H4G1 147 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.6 ms