RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSBP1O75506 76 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESDP10768 282 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 G0S2P27469 103 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00310P59036 64 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCTAP57738 103 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIRAPP58753 221 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMTP48728 403 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC7Q8TAX7 377 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01549A6NIU2 74 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUPR1O60356 82 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 LELP1Q5T871 98 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM18Q96B42 140 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM243Q9BU79 118 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf52A6NGY3 159 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 HBDP02042 147 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 APLNQ9ULZ1 77 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7C423 109 aa11.68□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A096LNJ9 63 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMCHL1Q16048 86 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESRGQ1W209 222 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOMM6Q96B49 74 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2L6O14933 153 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL18P55774 89 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A2P29034 98 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKIAP61925 76 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.65□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf84H3BNL1 204 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERASQ7Z444 233 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEPROTL1O95214 131 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPSP0C0P6 89 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5LO75964 103 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF6P10767 208 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE6Q13070 117 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMM17AQ99595 171 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGIPA6NJ69 53 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM262E9PQX1 116 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM141Q96I45 108 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK3BQ9BT76 320 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GUV1 79 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP4P15090 132 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM101Q96IK0 257 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WX48 190 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASC10Q5T4H9 136 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFITM10A6NMD0 228 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBX1P62877 108 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPV17L2Q567V2 206 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZN92 141 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIVA1O15304 175 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.55□□□□□ -0.56
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