RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSTL1Q9H114 145 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHODO00212 210 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RS1O15537 224 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCGB1D1O95968 90 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HBDP02042 147 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRM2P04554 102 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HTN1P15515 57 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTDAPP60985 99 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C16orf74Q96GX8 76 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 S100A12P80511 92 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAGE3Q14657 143 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q5VSD8 79 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PET117Q6UWS5 81 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST20Q9HBF5 79 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H7C1H1 209 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIDEAO60543 219 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RRN3P1Q2M238 152 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR11H2Q8NH07 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01549A6NIU2 74 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VCYO14598 125 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCAPO15273 167 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-53P01767 116 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF56Q15929 161 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01545Q5VT33 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZTC4 211 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NACAE9PAV3 2078 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 G0S2P27469 103 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 X6R8D5 127 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAT1Q14517 4588 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C20orf202A1L168 122 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP5LO75964 103 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PKIAP61925 76 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZSN1 163 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZTI0 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TOMM6Q96B49 74 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUDT3O95989 172 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GHRHP01286 108 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHOHQ15669 191 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DL4Q99706 377 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSTD3H0UI37 97 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 I3L3M4 83 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF479Q96JC4 524 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VAMP8Q9BV40 100 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSHBP01222 138 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP10-2P60368 255 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERASQ7Z444 233 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYRM9A8MSI8 78 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 K7EQD1 137 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XGP55808 180 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12BA1L429 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGIPA6NJ69 53 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE7O76087 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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