RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 COLCA2A8K830 154 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 D6R8Y8 96 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R17O96001 155 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 COTL1Q14019 142 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 CHCHD5Q9BSY4 110 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DQA1P01909 254 aa20.33■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 C10orf126Q8N4M7 172 aa20.33■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 FAT2Q9NYQ8 4349 aa20.31■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 I3L3M4 83 aa20.31■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM262E9PQX1 116 aa20.3■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 PPBPP02775 128 aa20.3■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 MT-ND6P03923 174 aa20.3■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 BTF3P20290 206 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 PMCHP20382 165 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 A0A087WX48 190 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF6BO95407 300 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 CHCHD7Q9BUK0 85 aa20.29■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 AMTP48728 403 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 ORMDL3Q8N138 153 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM243Q9BU79 118 aa20.28■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 NPYP01303 97 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 GAGE6Q13070 117 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 MPV17L2Q567V2 206 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf78Q9BR46 151 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-202ENST00000401498 TSHBP01222 138 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 APCSP02743 223 aa20.26■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 VCYO14598 125 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1644Q3SXP7 199 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 PRELID3AQ96N28 172 aa20.25■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 PHOX2AO14813 284 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 RAB5AP20339 215 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 PKIAP61925 76 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 Q8N976 141 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00336Q6ZUF6 198 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 KLK12Q9UKR0 248 aa20.23■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 RPL32P62910 135 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 LAGE3Q14657 143 aa20.22■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 RBX1P62877 108 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 FABP9Q0Z7S8 132 aa20.21■□□□□ 0.83
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS29PA6NIE9 313 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 NFE4Q86UQ8 179 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 Q9HAA7 133 aa20.2■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2L6O14933 153 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 ESDP10768 282 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL4Q99706 377 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM2Q9BVW6 85 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GUV1 79 aa20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 ANGP03950 147 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 TNP2Q05952 138 aa20.17■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 FCER1GP30273 86 aa20.16■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS47A8MTI9 375 aa20.15■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PKDCC-202ENST00000401498 PKD1P98161 4303 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 H7C423 109 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 TRGC2P03986 189 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf203Q8NBC4 194 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2WQ96B02 151 aa20.14■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 ENHOQ6UWT2 76 aa20.12■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa20.12■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 MAP1LC3AQ9H492 121 aa20.12■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 FGF6P10767 208 aa20.11■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00269Q8N2A0 174 aa20.11■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 PRR34Q9NV39 138 aa20.1■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa20.1■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 TCAPO15273 167 aa20.09■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GVY2 172 aa20.08■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 Q0VG73 95 aa20.08■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa20.08■□□□□ 0.81
PKDCC-202ENST00000401498 DNAH11Q96DT5 4516 aa20.08■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 CRPP02741 224 aa20.08■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 CLPSL2Q6UWE3 100 aa20.08■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 Q8N8P6 123 aa20.06■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 REG3AQ06141 175 aa20.05■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 TM2D2Q9BX73 214 aa20.04■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa20.04■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 PSCAO43653 123 aa20.04■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 MIAQ16674 131 aa20.03■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 C18orf32Q8TCD1 76 aa20.03■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 RMI2Q96E14 147 aa20.03■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKDCC-202ENST00000401498 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa20.01■□□□□ 0.79
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa20.01■□□□□ 0.79
PKDCC-202ENST00000401498 COX11Q9Y6N1 276 aa20.01■□□□□ 0.79
PKDCC-202ENST00000401498 RPL39P62891 51 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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