RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2E1P51965 193 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRC-202ENST00000367364 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-202ENST00000367364 CD164Q04900 197 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-202ENST00000367364 PLGLAQ15195 96 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-202ENST00000367364 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRC-202ENST00000367364 PRR15Q8IV56 129 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRC-202ENST00000367364 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-202ENST00000367364 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRC-202ENST00000367364 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM89A2RUT3 159 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 KNCNA6PVL3 124 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFC1O43677 76 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL13O43927 109 aa2.38□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.37□□□□□ -2.03
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