RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323319.6

CLDN22-201, Transcript of claudin 22, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN22, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22-201ENST00000323319 VCYO14598 125 aa11.36□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 RAX2Q96IS3 184 aa11.36□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.36□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.35□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF56Q15929 161 aa11.35□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 Q8N2B8 174 aa11.35□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.35□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 C11orf86A6NJI1 115 aa11.34□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 KNCNA6PVL3 124 aa11.34□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 CRYGDP07320 174 aa11.34□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 HERVK_113P61574 105 aa11.34□□□□□ -0.59
CLDN22-201ENST00000323319 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 DUX3Q96PT4 197 aa11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 DEFB131AP59861 70 aa11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.33□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TSHBP01222 138 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF876PQ49A33 203 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 APCP25054 2843 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 IGIPA6NJ69 53 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 M0QY20 66 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 EMP1P54849 157 aa11.32□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 PEMTQ9UBM1 199 aa11.31□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 IGHV3-33P01772 117 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 HTN1P15515 57 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM141Q96I45 108 aa11.3□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 A4D1N5 150 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 PMVKQ15126 192 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TIMM17AQ99595 171 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 ITPR3Q14573 2671 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 H3BMM0 161 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 P0DMU3 169 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 FAM231AP0DMU4 169 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 FAM231CP0DMU5 169 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.29□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 H7C2G1 150 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 AMELXQ99217 191 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 LINC01620Q4KN68 170 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.28□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 ATXN8Q156A1 80 aa11.27□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.27□□□□□ -0.6
CLDN22-201ENST00000323319 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.27□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 A8MTW9 85 aa11.27□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.27□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 LINC01600Q96MT4 127 aa11.27□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 RHOHQ15669 191 aa11.26□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.26□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 J3QQQ9 107 aa11.26□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 A0A0B4J2C4 111 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 PRM2P04554 102 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 Q6ZSV7 163 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.25□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM86BQ8N661 226 aa11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 I3L3M4 83 aa11.24□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 Q1RN00 199 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 UBE2WQ96B02 151 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.23□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 CHD6Q8TD26 2715 aa11.22□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.22□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 M0R2P5 195 aa11.22□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 PROK1P58294 105 aa11.22□□□□□ -0.61
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF415Q09FC8 603 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms