RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311694.7

HECTD4-201, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 2,734 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF56Q15929 161 aa5.9□□□□□ -1.46
HECTD4-201ENST00000311694 C5orf47Q569G3 176 aa5.9□□□□□ -1.46
HECTD4-201ENST00000311694 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.9□□□□□ -1.46
HECTD4-201ENST00000311694 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.9□□□□□ -1.46
HECTD4-201ENST00000311694 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HECTD4-201ENST00000311694 H7C2G1 150 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 H7C423 109 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 J3QQQ9 107 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 M0R381 172 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PMVKQ15126 192 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 GPHB5Q86YW7 130 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.9□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C2orf82Q6UX34 121 aa5.89□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TRIAP1O43715 76 aa5.89□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.89□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C16orf92Q96LL3 132 aa5.89□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 U3KQE9 123 aa5.89□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 H3BT86 120 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 DUX3Q96PT4 197 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 J3QLI3 93 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF876PQ49A33 203 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 USMG5Q96IX5 58 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 IMUPQ9GZP8 106 aa5.88□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PDZD2O15018 2839 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SPRY2O43597 315 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 NDUFA7O95182 113 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 IGLV1-40P01703 118 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM141Q96I45 108 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM223A0PJW6 202 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 NDUFA4O00483 81 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PRR9Q5T870 116 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM101Q96IK0 257 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C20orf173Q96LM9 149 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 TIMM17AQ99595 171 aa5.87□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 F6UB75 175 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LEPROTO15243 131 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PLA2G2AP14555 144 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 Q1RN00 199 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 J3QKU1 62 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PPP1R17O96001 155 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 CFHR3Q02985 330 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SPXQ9BT56 116 aa5.86□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 A0A0J9YX75 114 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 UQCRQO14949 82 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 PSMB8P28062 276 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 HERVK_113P63121 156 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 Q6YL49 198 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 HIVEP2P31629 2446 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 JMJD1CQ15652 2540 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 A0A087WW49 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 A0A1B0GX51 115 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 H3BUA1 57 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 WIPF1O43516 503 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 MGPP08493 103 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LINC00315P59091 139 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 DEFB136Q30KP8 78 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.85□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 FSHBP01225 129 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF702PQ9H963 129 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LST1O00453 97 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 SYNJ2BPP57105 145 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 LITAFQ99732 161 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.84□□□□□ -1.47
HECTD4-201ENST00000311694 A0A0J9YXY3 114 aa5.83□□□□□ -1.48
HECTD4-201ENST00000311694 J3KT08 172 aa5.83□□□□□ -1.48
HECTD4-201ENST00000311694 ACYP1P07311 99 aa5.83□□□□□ -1.48
HECTD4-201ENST00000311694 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HECTD4-201ENST00000311694 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.2 ms