RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00694P0DN24 101 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 SUMO4Q6EEV6 95 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 CLEC2BQ92478 149 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 H3BUX3 64 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 MED14OSP0DP75 135 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 DEFB121Q5J5C9 76 aa18.28■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM101Q96IK0 257 aa18.27■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 SDHAF1A6NFY7 115 aa18.27■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 F6UB75 175 aa18.27■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 EDN2P20800 178 aa18.27■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PKDCC-201ENST00000294964 TRGV11A0A075B6L2 103 aa18.26■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa18.26■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa18.26■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00477Q96M19 166 aa18.26■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZSV7 163 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 U3KQE9 123 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 A0A0J9YX75 114 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 KLK9Q2XQG4 91 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 KLK9Q9UKQ9 250 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 ZANQ9Y493 2812 aa18.25■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 PF4V1P10720 104 aa18.24■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 A0A087WWL8 130 aa18.24■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 C19orf54Q5BKX5 351 aa18.24■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC30Q96LL9 226 aa18.24■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 LITAFQ99732 161 aa18.24■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 PRSS2P07478 247 aa18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf139Q6ZV77 190 aa18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 F5H697 171 aa18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 NXPH4O95158 308 aa18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 PIMREGQ9BSJ6 248 aa18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf153Q5TBE3 101 aa18.22■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 COX6CP09669 75 aa18.22■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 ATP5J2P56134 94 aa18.22■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 A0A0J9YXV3 536 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 LST1O00453 97 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 AVPP01185 164 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 HECTD1Q9ULT8 2610 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa18.21■□□□□ 0.51
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFA7O95182 113 aa18.2■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.2■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.2■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa18.19■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 C3orf22Q8N5N4 141 aa18.19■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 FAM223BA6NKX1 122 aa18.19■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 FAM223AQ8IWN6 122 aa18.19■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa18.18■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 I3L3M4 83 aa18.17■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 NPC2P61916 151 aa18.17■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 IMUPQ9GZP8 106 aa18.17■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 ITPR2Q14571 2701 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 OVOL1O14753 267 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 FAM19A4Q96LR4 140 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 C10orf99Q6UWK7 81 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 SPXQ9BT56 116 aa18.16■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 NAV2Q8IVL1 2488 aa18.15■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 HERVK_113P63121 156 aa18.15■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 SMCR5Q8TEV8 140 aa18.15■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PKDCC-201ENST00000294964 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa18.14■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 SORL1Q92673 2214 aa18.14■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa18.14■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 FAM74A4Q5TZK3 123 aa18.14■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFA4O00483 81 aa18.13■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 UQCRQO14949 82 aa18.13■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 IGHG2P01859 326 aa18.13■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 TIMM21Q9BVV7 248 aa18.13■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa18.13■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 PDZD2O15018 2839 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 A6NDX4 124 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 APRG1Q8IVJ8 170 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 SPANXDQ9BXN6 97 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 SPANXCQ9NY87 97 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 SOCS3O14543 225 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 C5orf47Q569G3 176 aa18.12■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa18.11■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 MSMBP08118 114 aa18.11■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 CUBNO60494 3623 aa18.11■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 RHOHQ15669 191 aa18.11■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00526Q96FQ7 95 aa18.11■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 ACYP1P07311 99 aa18.1■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 MIAQ16674 131 aa18.1■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM61Q8N0U2 210 aa18.1■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 C20orf203Q8NBC4 194 aa18.1■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.08■□□□□ 0.49
PKDCC-201ENST00000294964 DUX5Q96PT3 197 aa18.08■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFA12Q9UI09 145 aa18.08■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 M0QY20 66 aa18.07■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00643Q86TS7 51 aa18.07■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 DCANP1Q8TF63 244 aa18.07■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 SMIM9A6NGZ8 99 aa18.06■□□□□ 0.48
PKDCC-201ENST00000294964 J3KT08 172 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms