RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 K7EQD1 137 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 C18orf15Q96N68 181 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 COLCA2A8K830 154 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 GAGE10A6NGK3 116 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 CKS2P33552 79 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 CASC10Q5T4H9 136 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 RHODO00212 210 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 NPYP01303 97 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 TRGC2P03986 189 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 APCSP02743 223 aa7.52□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 RHOHQ15669 191 aa7.52□□□□□ -1.2
TTPA-201ENST00000260116 RASL11AQ6T310 242 aa7.52□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 Q8N3U1 123 aa7.52□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 NRACQ8N912 160 aa7.52□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 RAB5AP20339 215 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 IQCJQ1A5X6 159 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 SRIP30626 198 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 MRAP2Q96G30 205 aa7.51□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 NUPR2A6NF83 97 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ESRGQ1W209 222 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PRELID3AQ96N28 172 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 HLA-DQA1P01909 254 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ORMDL3Q8N138 153 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 APLNQ9ULZ1 77 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 IFITM10A6NMD0 228 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 UBE2D3P61077 147 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 UBE2D2P62837 147 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.48□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 H7C1H1 209 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 GAGE6Q13070 117 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 ST20Q9HBF5 79 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.47□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PHOX2AO14813 284 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 LINC00694P0DN24 101 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 PMCHL1Q16048 86 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 V9GYY9 64 aa7.46□□□□□ -1.21
TTPA-201ENST00000260116 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.46□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 LY6G6CO95867 125 aa7.46□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 MT-ND6P03923 174 aa7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 Q8N976 141 aa7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.45□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 BAALCQ8WXS3 180 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 TSHBP01222 138 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 SIGMAR1Q99720 223 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.44□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 RYR3Q15413 4870 aa7.43□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 H3BNG1 76 aa7.43□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 M0R2N4 97 aa7.43□□□□□ -1.22
TTPA-201ENST00000260116 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms