RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636607.1

ARID1B-217, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 3

Gene ARID1B, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-217	ENST00000636607	IFNA7	P01567	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		H3BVH4	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TCRA	P04437	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	RAB2A	P61019	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	UBE2D3	P61077	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PKIA	P61925	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	UBE2D2	P62837	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SERF2	P84101	59 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	GAGE6	Q13070	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SLPI	P03973	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	RAB14	P61106	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	RBX1	P62877	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CACNG7	P62955	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		Q6ZRP5	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		M0R381	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	REG3A	Q06141	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		A0A1B0GV50	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		B4DEV8	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		M0R036	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	IFNA1	P01562	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	GCHFR	P30047	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF56	Q15929	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CXorf1	O96002	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607		P01737	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SULT1A2	P50226	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARID1B-217	ENST00000636607	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607		A0A096LNI7	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607		A0A1W2PRE2	83 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607		F5H697	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	MT-ND6	P03923	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	GZMB	P10144	247 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	FHIT	P49789	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARID1B-217	ENST00000636607	CRIP1	P50238	77 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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