RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587208.5

ZNF542P-208, Transcript of zinc finger protein 542, pseudogene, human

TSL 4

Gene ZNF542P, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF542P-208	ENST00000587208	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	CACNG7	P62955	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	AGRN	O00468	2067 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ZNF542P-208	ENST00000587208	INS	P01308	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	NTF3	P20783	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	LINC01587	Q99440	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	HTN1	P15515	57 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	CD164	Q04900	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	FHL2	Q14192	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SORL1	Q92673	2214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		F5H768	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		M0R381	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SRI	P30626	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	EVI2A	P22794	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	G0S2	P27469	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		Q6ZRP5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	PRM2	P04554	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		Q0VG73	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		D6R8Y8	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	MGP	P08493	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	FABP4	P15090	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	CKS2	P33552	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208		U3KQK5	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF542P-208	ENST00000587208	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms