RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.48□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.48□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRAP2Q96G30 205 aa7.48□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.48□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.48□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED14OSP0DP75 135 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 AP1S3Q96PC3 154 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 PEMTQ9UBM1 199 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIVEP1P15822 2718 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL24O00175 119 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 LAGE3Q14657 143 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf85Q96MD7 179 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 ODF3Q96PU9 254 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.46□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
CCNDBP1-210ENST00000566882 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 F5H697 171 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 HLA-DRB4P13762 266 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB37Q96AX2 223 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE12BA1L429 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 PROK1P58294 105 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 FHL3Q13643 280 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 LY6G6DO95868 133 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRYGDP07320 174 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF876PQ49A33 203 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTH2Q96A98 100 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 JMJD8Q96S16 334 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q9UF83 564 aa7.44□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKCP01834 107 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP10-3P60369 221 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX29Q8N6K0 151 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 NACAE9PAV3 2078 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 P0DMU3 169 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM231AP0DMU4 169 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM231CP0DMU5 169 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF56Q15929 161 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZMAT4Q9H898 229 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 XCL2Q9UBD3 114 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MTW9 85 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 K7ERJ3 54 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 HILS1P60008 231 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 C20orf78Q9BR46 151 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BUT2 72 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 C16orf95Q9H693 158 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 GCSHP23434 173 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 FXYD2P54710 66 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0QY20 66 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 DPM2O94777 84 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 EMP1P54849 157 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE5Q13069 117 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE6Q13070 117 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 INAFM1C9JVW0 142 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZSN1 163 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 TOMM6Q96B49 74 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 B5MCH6 92 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01587Q99440 93 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP5LO75964 103 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 TSHBP01222 138 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSD52Q0P140 79 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYT8Q8NBV8 401 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.39□□□□□ -1.23
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