RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.26	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GUT8	65 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRGC1	P0CF51	173 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	NTF3	P20783	257 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SVBP	Q8N300	66 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	PRO0255	Q9UI72	69 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	IGLL5	B9A064	214 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	CRYGD	P07320	174 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM17	P0DL12	118 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	CRYBA4	P53673	196 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	RHEB	Q15382	184 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	IMMP2L	Q96T52	175 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TENM2	Q9NT68	2774 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		A0A087WWC5	75 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GW15	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SNAPIN	O95295	136 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	APOC3	P02656	99 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	RAB4B	P61018	213 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	RHOH	Q15669	191 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	JPT2	Q9H910	190 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0A0MQY5	61 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SST	P61278	116 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	RIG	Q13278	110 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0J9YY99	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		K7EQD1	137 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	S100A8	P05109	93 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	EVI2A	P22794	236 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00315	P59091	139 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF56	Q15929	161 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	FRZB	Q92765	325 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
NUMB-231	ENST00000559312		H7C1H1	209 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	S100P	P25815	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	HBB	P68871	147 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	BTF3L4	Q96K17	158 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312		A0A096LPF7	62 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GXF2	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312		P0DMU3	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	FAM231A	P0DMU4	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	FAM231C	P0DMU5	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	SRI	P30626	198 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312		M0QY20	66 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MGP	P08493	103 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	CAMP	P49913	170 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LYST	Q99698	3801 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00694	P0DN24	101 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	RAB4A	P20338	218 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	CCL18	P55774	89 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MRAP2	Q96G30	205 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	NIT2	Q9NQR4	276 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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